A Rovetta és Bormio közötti 222 kilométeres szakaszon - amelyen három hegyet is megmászott a mezőny - a favorit Nairo Quintana harmadikként zárt.
Az összetettben második kolumbiai kerekes több mint két percet csökkentett hátrányán Dumoulinnal szemben.
A holland éllovas az utolsó emelkedőn
emésztési problémákkal küszködött, félredobta kerékpárját, levette ruháját és rövid időre eltűnt az út menti árokban.
Ennek ellenére folytatta a versenyt, de teljesen kimerülten érkezett be a célba.
Eredmény, 16. szakasz, Rovetta-Bormio, 222 km:
1. Vincenzo Nibali (olasz, Bahrain) 6:24:22 óra
2. Mikel Landa (spanyol, Team Sky) azonos idővel
3. Nairo Quintana (kolumbiai, Movistar) 12 másodperc hátrány
Az összetett élcsoportja:
1. Tom Dumoulin (holland, Sunweb) 70:14:48 óra
2. Quintana 31 mp hátrány
3. Nibali 1:12 perc hátrány
Szerdán a Tirano és Canazei közötti 219 kilométeres szakasz vár a mezőnyre, hegyi befutóval.