A szakemberek úgy vélték, hogy a merényletekhez felhasznált repülőgépek eltérítői kihasználhatták az amerikai belföldi légi közlekedés laza biztonságát, legyűrték a gépek személyzetét és átvették repülőgépek irányítását.
Kizárható ugyanakkor, hogy az amerikai légitársaságok pilótái vezették volna saját gépeiket az épületeknek."Nem tartom elképzelhetőnek, hogy bármely pilóta tudatosan hajlandó lenne nekirepülni gépével egy célpontnak, még akkor sem, ha pisztolyt tartanak a fejéhez" - mondta egy tapasztalt pilóta a Reutersnek.
A szakemberek elmondták, hogy nem nehéz feladat pontosan neki repülni toronyházhoz hasonló célpontoknak, az ehhez szükséges tapasztatok könnyen megszerezhetőek, ráadásul már három hónap alatt pilótaengedélyt lehet szerezni. Az eltérített gépek is olyan tervezésűek voltak, hogy könnyen lehessen vezetni őket.