Mathieu Ngudjolo a Nacionalisták és Integracionisták Frontja (FPI) elnevezésű milícia vezetője volt az északkelet-kongói Ituri tartományban kitört fegyveres konfliktus idején, mely az 1998-2003 közötti polgárháború kezdete volt. A kongói hatóságok szerdán tartóztatták le. Ő a harmadik kongói gyanúsított személy, akit az ICC utasítása alapján vettek őrizetbe.
A működését 2002. július elsején megkezdő, hágai székhelyű Nemzetközi Büntetőbíróság joghatósága a népirtás bűntettére, valamint az emberiesség elleni és a háborús bűncselekményekre terjed ki.
Az ituri konfliktus része volt a kilencvenes évek végén kitört, hat országot érintő kongói háborúnak, amelynek során öt év alatt 3 millió ember halt meg, főképp a harci cselekményeket kísérő éhínségben vagy betegségekben.