Cutajar januárban mondott le a rendőrfőkapitányi posztról, miután a civil társadalom és a meggyilkolt újságírónő, Daphne Caruana Galizia családja azzal vádolta meg, hogy akadályozta a gyilkosság felderítését, valamint hogy nem tett meg mindent az újságíró védelmében, amikor még élt, és a legfelsőbb szintig is elérő korrupciós ügyekben nyomozott.
Három ember ellen folyik eljárás a gyilkosság végrehajtása ügyében, Jorge Fenech üzletember ellen pedig bűnrészességért, mert őt vádolják Caruana megölésének kitervelésével. Mindeddig mindannyian ártatlannak vallották magukat. Fenechet azután tartóztatták le, hogy Melvin Theuma, aki közvetítő volt a gyilkossági tervben, az ügy koronatanújává lépett elő, és kegyelmet kapott.
A Cutajar elleni nyomozást az újságíró családjának ügyvédei kérték, miután Theuma elárulta, hogy Cutajar információkat szivárogtatott ki neki. Hírügynökségek keresésére Cutajar nem válaszolt, de a Times of Malta című helyi lapnak azt mondta, hogy soha nem beszélt Theumával, pedig a bíróság előtt titkos felvételek bizonyítják, hogy beszélt.