A támadó áttört a biztonsági kordonon, és egy
kalasnyikov gépkarabéllyal lelőtte a biztonsági szolgálat vezetőjét.
A tűzpárbajban megsebesült két biztonsági őr állapota stabil - tették hozzá a közleményben.
A teheráni rendőrség közölte, hogy az azóta őrizetbe vett támadó két gyermekével együtt ment a nagykövetséghez, tettét pedig "családi, illetve személyes" okokból követte el.
Részletekről egyelőre nem számoltak be.
Tavaly Azerbajdzsán londoni és párizsi nagykövetségét is támadás érte, de akkor az elkövetők fegyvertelenek voltak.
Az azeri Irán második legnépesebb nemzetisége, a 82 milliós országban több mint 10 millióan élnek a tagjai közül.
Azerbajdzsán az Irán egyik régiós riválisának számító Törökország szövetségese.
Teherán többször adott hangot azon aggodalmának, hogy az Azerbajdzsán legnagyobb fegyverszállítójának számító Izrael azeri területről hajtana végre támadást Irán ellen.