"A feleségem hét hónapos terhes. A tervek szerint januárban fog megszületni a gyermekünk." - mondta Clapton, aki 2002-ben házasodott össze a nála 31 évvel fiatalabb Melia McEneryvel. A párnak már született az elmúlt években két lánya.
A zenésznek egy korábbi kapcsolatából van egy 19 éves lánya, akinek a létezését hosszú ideig titokban tartotta. Rövid kalandja volt Ruth édesanyjával, és a szülés óta nem igazán tartotta velük a kapcsolatot. A kilencvenes évek elején azonban tragikus dolog történt Clapton családjában, kiesett az énekes manhattani lakásának az ablakából az akkor négy éves fia, Conor, aki belehalt a zuhanásba. A tragikus eseményeket követően vette fel ismét a kapcsolatot Ruth-szal és az édesanyjával. A haláleset inspirálta emellett Clapton eddig talán legnagyobb slágerét, a Tears In Heaven című dalt.