A Japán Olimpiai Bizottság összesen 1,43 millió dollárt osztott szét az athéni játékokon eredményesen szerepelt versenyzők között. A legjobban honorált sportoló a kétszeres bajnok úszó, Kitadzsima Koszuke volt, aki produkciójával 65 ezer dollárt (13,4 millió forint) keresett.
Kitadzsima megnyerte a 100 és 200 méteres mellúszást, és harmadik lett a 4x100-as vegyesváltó tagjaként.
A japánok összesen 37 érmet - 16 aranyat, 9 ezüstöt és 12 bronzot - szereztek a görög fővárosban, ez rekord, hiszen az eddigi legjobb eredményük az 1984-es Los Angeles-i játékokról hazavitt 32 medál volt.
A 16 elsőség csúcsbeállításnak számít, ilyen sok aranyérmet eddig csak egyszer, az 1964-es tokiói - vagyis hazai rendezésű - olimpián gyűjtöttek.
A japánok az egyik aranyérmet annak köszönhették, hogy a kalapácsvető Annus Adriánt a doppingszabályzat megsértése miatt utólag kizárták, és helyette Kodzsi Murofusi lett a bajnok.