A szezonzáró brazil futam időmérő edzése előtt még nyílt volt a világbajnoki címért folyó küzdelem, bár a tíz pontos előnnyel vezető Fernando Alonso már ekkor is lépéselőnyben volt Michael Schumacherrel szemben. A szombati kvalifikáció azonban talán végleg eldöntötte az összetett elsőség sorsát. Az edzés utolsó etapjában ugyanis technikai hiba miatt a búcsúra készülő Michael Schumacher csak a 10. pozíciót tudta megszerezni, míg Renault-val versenyző riválisa a negyedik helyen landolt. A pole pozíciót a két héttel ezelőtti Japán Nagydíjhoz hasonlóan Schumacher csapattársa, a hazai közönsége előtt versenyző Felipe Massa szerezte meg. A szinte végig vezető brazil pilóta mellől a McLarenes Kimi Raikkönen indulhat, míg a harmadik pozíciót Jarno Trulli szerezte meg a Toyotával. A negyedik helyről a fentebb már említett Fernando Alonso rajtolhat, a spanyol márkatársa, Giancarlo Fisichella hatodikként zárt. A két Renault közé a Hondát terelgető Rubens Barrichello ékelődött be. A hetedik helyezett Ralf Schumacher a két BMW-s versenyzőt, Heidfeldet és Kubicát utasította maga mögé. A tizedik helyen pedig a szerencsével ezúttal hadilábon álló Michael Schumacher végzett, aki technikai hiba miatt nem tudott beleszólni az első helyekért folytatott harcba. A második etapban szokás szerint ezúttal is hatan búcsúztak el. Mark Webber került legközelebb a legjobb tízhez, de a Williams-Cosworth-szal versenyző ausztrál nem tudta magát az utolsó szakaszba kvalifikálni. Kimi Raikkönentől jócskán elmaradt márkatársa, Pedro de la Rosa, aki csak a tizenkettedik legjobb időt autózta. Szintén a második negyedóra után fejezte be a szereplést Nico Rosberg, Jenson Button és Robert Doornbos. A holland teljesítménye azért említést érdemel, hiszen megverte Red Bullos csapattársát, David Coulthardot. A tizenhatodik helyen Vitantonio Liuzzi futott be. A legrövidebb ideig köröző pilóták közt ezúttal sem volt különösebb meglepetés. Scott Speed (Toro Rosso) és David Coulthard mellett a két Midland pilóta, Christijan Albers és Tiago Monteiro, valamint a Super Agurival köröző versenyzők, Takuma Szato és Sakon Yamamoto fejezték be legkorábban a kvalifikációt.