A javaslat szerint ugyancsak komoly következményekkel járhat az is, ha gondatlanságból történik az előírások áthágása, börtön azonban csak a legvégső esetben járna. Fő szabályként továbbra is adminisztratív szankciókat alkalmaznának, tehát a gyártó cég forgalmazási engedélyének felfüggesztését, vagy egy nem elég biztonságosnak tekintett termék piacról való kivonását.
Különösen az unión kívüli országokból élelmiszeripari termékeket importáló cégek számíthatnak a tervezett új szabályok miatt szigorúbb, fokozottabb hatósági ellenőrzésre, azonban a reformjavaslat elsősorban a hatósági ellenőrzést érinti, a mezőgazdasági termelőkre és cégekre csak áttételesen vonatkozik.