Az intézmény elődjét a Békéscsabai Múzeum-Egyesület hozta létre. Az 1899. november 25-én alakult Múzeum-Egyesület működésének tizenöt éve alatt lerakta a gyűjtemények alapjait, megfelelő szakembereket nevelt, s tevékenységének betetőzéseként felépítette a múzeumnak helyet adó Közművelődés Házát. A múzeum–könyvtár–műterem–közművelődés négyes funkcióját ellátó intézmény számára készült épületet 1914-ben avatták fel. Ma is ez az épület ad otthont a múzeumnak, amely 1951-ben vette fel a gyermekkorát Békéscsabán töltő festőművész, Munkácsy Mihály nevét.
A Munkácsy Mihály Múzeum gyűjteménye természettudományi, régészeti, néprajzi, történeti, képzőművészeti gyűjteményi anyagokból tevődik össze.
Az intézmény kiemelkedő műtárgy-együttese a festményekből és relikviákból álló Munkácsy-gyűjtemény, melynek alapját a festő özvegyének végrendelete szerint az 1930-as évek elején a gyűjteménybe került műtárgyak képezik.
A Munkácsy Mihály Múzeum jelenlegi arculatát 2019-ban nyerte el, amikor is a múzeum műemléképületének és az 1970-es évek elején épült résznek az összeépítése megvalósult. Több éves előkészítő munka eredményeként 2020 szeptemberében megnyílt az „utazás TÉRben és IDŐben” című állandó kiállítás első egysége, a Munkácsy Mihály – Egy géniusz diadala című kiállítás, majd elkészült a Békéscsaba az évezredek idővonalán című tárlatrész is, amelyet 2021 májusától látogathat a közönség.
Az állandó kiállítások mellett változatos időszaki tárlatok színesítik a kínálatot, melyek egy része az „Ami csabai…" sorozat keretében gazdagítja a látogatóközönség ismereteit. Az időszaki kiállítások közül kiemelkedik a Hazafias festészet2 Munkácsy Mihály Honfoglalása című tárlat, mely a szegedi vázlatok révén ismerteti a Parlamentben található kép készítésének körülményeit.
Titkok által létező – holó Hóbel László festészete, illetve a Múzeumok Éjszakáján megnyitandó A mi háborúnk című, a 2. világháború helyi eseményeire fókuszáló tárlat.
Az intézmény nagy hangsúlyt fektet a látogatóbarát környezet kiépítésére: változatos közművelődési programokkal, múzeumpedagógiai foglalkozásokkal és tudományos-népszerűsítő kiadványokkal várja látogatóit. A múzeumi tartalmakhoz való széles körű hozzáférést a kiállítások, a kutatószolgálat, a digitális tartalmak, a szakmai és múzeumpedagógiai programok, valamint a közösségi média platformok biztosítják.
A Munkácsy Mihály Múzeum több szakágat érintő nemzetközi kapcsolatrendszere főként amerikai, görögországi, romániai és szlovákiai együttműködésekre épül. A Munkácsy Mihály Múzeum Az Év Múzeuma 2022 pályázaton a nagyszabású múzeumfejlesztési eredményeiért, látványos, szakmailag megalapozott új állandó kiállításáért, színvonalas kiadványaiért és a határon túli szakmai kapcsolatok példaértékű ápolásának elismeréseként a nagy múzeumok kategóriában elnyerte "Az év múzeuma 2022" kitüntető címet. Korábban már elnyerte az "Év múzeuma 2007" és a "Látogatóbarát múzeum 2008" megtisztelő címeket is. Legyen részese egy felejthetetlen utazásnak a művészet és a régi korok világában! Lépjen be a múzeum kapuján és engedje, hogy elbűvölje Munkácsy Mihály szellemisége és Békéscsaba történetének gazdagsága - írta meg a tenyek.hu.