A még tavaly szeptember végén megerősített és Carla del Ponte, a törvényszék főügyésze által aláírt vádirat szerint Ljubicic 1992 és 1993 nyara között részt vett a közép-boszniai Vitez és Busovaca, illetve környékük muzulmán lakossága elleni atrocitásokban.
A Horvát Védelmi Tanács (HVO) katonai rendőrségének századparancsnokaként Ljubicicot közvetett és közvetlen felelősség terheli azokért a támadásokért is, amelyeket a horvátok a muzulmánok lakta környékbeli falvak ellen hajtottak végre. Az 1993 áprilisában véghezvitt egyik ilyen rajtaütés során mintegy száz polgári személyt gyilkoltak meg, és sokakat súlyosan megsebesítettek. A támadások előtt Ljubicic azt a parancsot adta alárendeltjeinek, hogy valamennyi katonakorú muzulmánt öljék meg - áll a vádiratban. A polgári lakosok egy részét a horvát fegyveresek foglyul ejtették, majd arra kényszerítették, hogy lövészárkokat ássanak a frontvonalak mentén, ahol ugyancsak sokan haltak meg közülük. Másokat elűztek otthonukból, és Bosznia más részeibe szállították.