A 44 éves sportember a fővárosban, Biskekben bátyjával együtt éppen kiszállt autójából, amikor egy ismeretlen tettes kétszer fejbe lőtte.
A kétszeres Ázsia-bajnok Szanatbajev volt az egyik pályázó a megüresedett elnöki posztra hazájának olimpiai bizottságában. A testület korábbi vezetőjét, Bajaman Erkinbajevet szeptemberben ugyancsak meggyilkolták, a bűntény hátterében rendőrségi források szerint a börtönök kábítószer-ellátása állt.