A 30 esztendős futballista és a csapat vezetősége több megbeszélést követően sem tudott megegyezni a folytatásról, így Bodnár 72 mérkőzés és két bajnoki cím után elhagyta a klubot. A 39-szeres válogatott Bodnár profi pályafutását a Debreceni VSC-ben kezdte, majd az ukrán Dinamo Kijevben, és a holland Roda JC-ben szerepelt. 2006-ban szerződött a Red Bull Salzburg csapatához.