Az elmúlt idény közepén a New England Patriotstól megszerzett játékos ötéves, 137,5 millió dolláros megállapodást kötött a klubbal.
A 26 éves Garoppolót a 2014-es draft második körében választotta ki a New England, de három szezon alatt csak két meccsen léphetett pályára kezdőként, mivel az ötszörös bajnok
Tom Brady pozíciója 40 évesen is megkérdőjelezhetetlen.
Garoppolo ugyanakkor a 2016-os szezonban - amelyet Brady négymeccses eltiltással kezdett - az első két mérkőzésen fantasztikusan játszott, és már ekkor nagy jövőt jósoltak neki.
Az előző idény közepén végül a San Francisco 49ers egy második körös draftjogért megszerezte az irányítót, aki a 13. játéknapon kapta meg kezdőként a lehetőséget, majd a hátralévő öt összecsapáson győzelemre vezette a csapatot.
Ebben a rövid periódusban a Jimmy G becenévre hallgató játékos a legjobb statisztikákkal rendelkező irányító volt.