Molnár Csaba ügye 2003. december elején robbant ki: a Magyar Nemzet azt állította róla, hogy alvilági arab kapcsolatai vannak. Az először belső vizsgálatot, később ügyészségi nyomozást kiváltó cikkben azt írta a lap: megdönthetetlen bizonyítékok vannak arra vonatkozóan, hogy Molnár Csaba kapcsolatban állt arab pénzváltókkal.
A Magyar Nemzet szerint: "Az arab alvilági körökkel állítólag meglévő, ,az elfogadhatónál és a normálisnál sokkal mélyebb kapcsolat megkérdőjelezi az alezredes elfogulatlanságát többek között a K&H Equities Rt.-nél történt sikkasztás és pénzmosás kapcsán indult nyomozásban."
A cikk megjelenésével egy időben kiderült az is, hogy a Nemzetbiztonsági Hivatal egy titkos jelentést készített Molnárról. A vizsgálatban szereplő adatok - és az újságcikkben megjelent állítások - a rendőrségi belső vizsgálat szerint nem tettek szükségessé további vizsgálatokat vagy büntetőeljárást. Az ügyészség azonban néhány nappal később, december 9-én mégis nyomozást indított Molnárral kapcsolatban, később meggyanúsították, és vádat is emeltek ellene.
A rendőrtiszt ügye miatt érezhetően feszült lett a rendőrség és az ügyészség viszonya: a rendőri vezetők még a későbbi vádemelés ellenére is osztályvezetővé nevezték ki Molnár Csabát, aki néhány hónapig vádlottként is nyomozótisztként dolgozhatott a tavaly nyáron megalakult magyar FBI-nál. Csak azután helyezték rendelkezési állományba, hogy a vádemelés után egy újabb ügyben meggyanúsították.