Francina ("Fanny") Elsje Blankers-Koen 1918. április 26-án született a hollandiai Baarn városkában. Hatévesen már aktívan sportolt, versenyszerűen úszott. atlétikai karrierje 1935-ben kezdődött, amikor úgy döntött, belép az Amszterdami Hölgyek Atlétikai Klubjába.
Egy versenye során ismerkedett meg Jan Blankersszel, a holland olimpiai csapat vezetőjével, akinek bátorítására már az 1936-os berlini olimpián rajhoz állt. A 4x100 méteres váltóban 5., magasugrásban 6. lett.
Koen és Jan Blankers 1940-ben házasodtak össze, ám mindkettőjük karrierjét derékba törte a II. világháború. 1946-ban, a háborút követő első Európa-bajnokságon szülését követően 7 hónappal állt rajthoz, s két aranyérmet szerzett. Hollandiában nemzeti hősként ünnepelték. Az 1948-as olimpia idején hat világcsúcsot tartott, így számára igazi érvágás volt, hogy a szabályok értelmében csupán négy számban állhatott rajthoz.
A "repülő holland háziasszony" megnyerte a 100 és a 200 méteres síkfutást, a 80 méteres gátfutást, valamint tagja volt a 4x100 méteren aranyérmes holland váltónak is. Magas- és távolugrásban így már nem indulhatott, pedig mindkettő világcsúcsát ő tartotta... 1952-ben még szeretett volna indulni, ám lábsérülése meggátolta ebben. Három évvel később visszavonult.
Hollandiában 58 bajnoki címet szerzett és nevéhez számos világcsúcs is fűződik. 1999-ben a XX. század legjobb atlétájává választották.
Utolsó éveiben Alzheimer-kórt diagnosztizáltak nála, pszichiátriai otthonban hunyt el 2004. január 25-én.