A programmal Michigan Egyetemen kifejlesztett adatbázisban, az Oncomine-ban összegyűjtött ún. génexpressziós vizsgálatok, azaz microarrayek eredményeit elemezték. A microarray-vizsgálat lényege, hogy a daganatos és az egészséges sejtek működését, a gének kifejeződését hasonlítják össze, méghozzá a sejtekben lévő hírvivő RNS-molekulák jellemzésével. A hírvivő, azaz mRNS egy információhordozó molekula a sejtben, mely az örökítőanyagtól, a DNS-től szállítja az információt a fehérjeképződés helyére, azaz a riboszómákhoz. Az RNS-ek vizsgálata értékes információkat szolgáltat a sejt génjeinek működéséről.
A microarray-vizsgálatok során egy üvegfelületre visznek föl olyan molekulákat, melyek különböző RNS-eket kötnek meg. Ezeket a speciális molekulákat (oligonukleotidokat) egyesével, egymás mellé pöttyözik föl a lemezen, így minden egyes pöttyről tudni lehet, hogy milyen RNS-t köt meg. Egy-egy ilyen ún. chip több száz, vagy akár több ezer gén vizsgálatát teszi lehetővé egyidejűleg. A daganatos sejtekből kivont RNS-eket egy reakció során átírják DNS-sé, miközben egy speciális fluoreszcens festékkel megjelölik a képződő DNS-t (ennek a színe általában piros). Ugyanezzel az eljárással az egészséges sejtből származó RNS-eket is DNS-sé alakítják át, de a jelölést egy más színű fluoreszcens festékkel, általában zölddel végzik. Az így elkészített kivonattal mossák a chipet, melyen a pöttyöknek megfelelően megkötődnek a színes DNS-molekulák. A pontokat aztán egy speciális eljárással láthatóvá teszik, azaz az adott pötty világítani fog. A piros és a zöld szín erőssége attól függ, hogy a kiindulási mintákban mennyi volt jelen a pöttynek megfelelő géntermékből (RNS). A vizsgálat értékelése során a piros szín, azaz a daganatos mintában lévő géntermék mennyiségét hasonlítják össze a zölddel, ami tehát az egészséges mintában lévő géntermék mennyiségének felel meg. Az összehasonlítással megállapítják, hogy a daganatos sejtekben hogyan változik egyes gének működése az egészséges sejthez képest: fokozódik vagy éppen csökken, esetleg egyáltalán nem változik.
Bodrogi Lilla - Simon Tamás