A megyei jogú városokban három szavazólapot kapnak a választók október 20-án. Három helyi kérdésben dönthetnek. Szavazhatnak a helyi polgármesterről. A polgármesterjelöltek közül egyet lehet választani. A polgármester az lesz, aki a legtöbb szavazatot kapja.
Szavazhatnak a helyi önkormányzat képviselőiről. A választáson egyéni jelöltek indulnak, akik közül egyet lehet választani. Az önkormányzati képviselőhelyek 60 százalékát a legtöbb szavazatot szerzett képviselők kapják. A választás után minden jelöltállító szervezet vesztes jelöltjei által összegyűjtött szavazatokat is összeszámolják. A képviselőhelyek fennmaradó 40 százalékát a vesztes szavazatok arányában nyerik el a jelölő szervezetek.
Ha a városban kezdeményeztek kisebbségi választásokat, akkor a megyei jogú városok választói szavazhatnak a helyi kisebbségi önkormányzatok összetételéről is. Mindenki csak egy kisebbség jelöltjeire szavazhat. A választott kisebbség jelöltjei közül többet is - legfeljebb ötöt - lehet választani. A szavazat akkor is érvényes, ha a választó ötnél kevesebb jelöltre szavaz. A választás után az a kisebbség alakíthat önkormányzatot, amelynek jelöltjeire legalább 100 választópolgár adott le érvényes szavazatot. Egy megyei jogú város kisebbségi önkormányzatának legfeljebb öt képviselője lehet. Képviselők azok a jelöltek lesznek, akik a legtöbb szavazatot kapják. A kisebbségek képviselőinek lehetőségük van arra is, hogy országos kisebbségi önkormányzat összehívását kezdeményezzék.
Az önkormányzati választás a megyei jogú városokban akkor is eredményes, ha csak egy érvényes szavazatot adnak le a választók. Ez alól csak a kisebbségi önkormányzati választás kivétel, mert ott minden kisebbségnek legalább 100 érvényes szavazatot kell szereznie ahhoz, hogy önkormányzatot alapíthasson a településen.
A választás eredménytelen, ha nincs elég jelölt ahhoz, hogy a település képviselőtestülete teljes létszámban összeülhessen. A választás akkor is eredménytelen, ha a helyi képviselőtestület, vagy a polgármester megválasztásánál szavazategyenlőség alakul ki. Ezekben az esetekben a választás napja után 6 hónappal időközi választást kell tartani, addig pedig az 1998-ban megválasztott képviselőtestület, vagy az 1998-ban megválasztott polgármester folytatja munkáját.