Klubja nem sokkal később eladta első számú csatárát, Fernando Torrest, és bár a helyére érkezett az uruguayi Diego Forlán, de nyilvánvaló volt, hogy immár Agüerótól is sokkal többet várnak - az ifjú argentin pedig eddig nem okozott csalódást.
A bajnokságot bombaformában kezdte, az első hat fordulóban hat gólt ért el, miközben az Intertotó-kupában, majd az UEFA-kupában is eredményesen futballozott. Külön öröm lehetett a számára, hogy végre a nagyválogatottban is meg tudta szerezni első találatát, ráadásul tétmérkőzésen: az albiceleste színeiben a Bolívia elleni világbajnoki selejtezőn volt eredményes, mégpedig fejjel - bizonyítva, hogy viszonylag alacsony termete ellenére a fejjátéka is kiváló.
Nem csoda, hogy a 2007-es esztendő végén szinte minden korosztályos elismerést besöpört: az olasz Tuttosport Golden Boy nevű szavazásán ő lett az első, és a FIFA is őt választotta meg az esztendő legjobb fiatal labdarúgójának.
Agüero a szezon további részében is hasonlóan jól futballozott, ő lett a liga harmadik leggólerősebb játékosa 19 találattal.
Az egyetlen negatívum az idényben a számára, hogy három piros lapot is kapott, pedig korábban pályafutása során mindössze egyszer állították ki. Most a bajnokságban a Getafe CF és az RCD Espanyol, az UEFA-kupában pedig a Bolton Wanderers ellen küldték le a pályáról, általában törlesztés miatt.
Sokak szerint ebben is hasonlít Maradonához, aki karrierje elején ugyancsak nehezen viselte, hogy az ellenfelek faragják, ám idővel megtanulta kezelni a dolgot. Kun első kézből kérheti ki az egykori világklasszis tanácsait, hiszen Agüero jelenlegi barátnője nem más, mint Maradona lánya, Giannina.