Holger Badstuber kálváriája decemberben kezdődött, amikor a Dortmund elleni bajnoki első félidejében térdszalag-szakadást szenvedett. Műtétjét követően már a rehabilitációs időszakot töltötte, de ismét elszakadt a keresztszalagja, így rá 2013-ban már nem számíthat a Bayern
A Bayern sportigazgatója, Matthias Sammer ígéretet tett arra, hogy a klub továbbra is támogatja a védőt. "Nem akarok időt mondani, mikortól számíthatunk rá ismét, de vissza fog térni, és azt hiszem, erősebb lesz, mint valaha, főleg mentálisan."
Veszélybe került a dortmundi Mats Hummels Bajnokok Ligája-döntős szereplése is, miután bokasérülést szenvedett a szombati Hoffenheim elleni bajnokin. Jürgen Klopp szerint a pontos diagnózisra várni kell, de fél, hogy a duzzadt boka nem jön rendbe a jövő szombati, Bayern elleni fináléig.