A középpályás a tavalyi szezon végén bejelentette visszavonulását, ám januárban a sok sérült miatt visszatért a csapathoz, és a gárda egyik meghatározó játékosa volt. Az MU végül a második helyen végzett a városi rivális Manchester City mögött.
Annak ellenére, hogy a hatvanhatszoros angol válogatott Scholes csak a bajnokság felében játszott, a harmadik helyen végzett az Év játékosa szavazáson.