Pongor Sándor

Az adathalmoktól a rendezett információs hálózatokig - Bioinformatika és rendszerbiológia

Nézzünk erre példákat. Az esetek többségében egy feltételezett új fehérje csak egyetlen csoportra hasonlít, és ennek egyetlen szerkezet és egyetlen funkció felel meg. Ezek a biztos tippek. Vannak azonban olyan fehérjék, melyek kétféle csoportra is hasonlítanak. Itt jön a segítségünkre a többi adat, melyek révén végül is csak egyfajta formának és egyfajta funkciónak feleltethetjük meg a fehérjét. Tehát ismét igen biztos tippet kaptunk, ráadásul felfedeztünk egy új, átmeneti esetet. Vannak azonban reménytelen esetek is, például egy szekvencia többféle csoportra, többféle alakra és funkcióra is hasonlít. Ilyenkor további információkat kell igénybe vennünk. Itt vannak például a szakcikkek kulcsszavai, ezek alapján a szakcikkekről is van egy rendezett adatbázisunk. Ha szerencsénk van - és ebben a példában legyen egyszer szerencsénk - akkor a kulcsszavak alapján kiderülhet, hogy az eddig vizsgált kétféle funkciónak lehet köze egymáshoz. Itt tehát ismét egy felfedezést tettünk, kibővíthetjük eddig ismert csoportjainkat. Vagyis tudásunk, tudásbázisunk is gyarapodott.

Valójában nemcsak néhány információféleséget kezelünk, ahogy itt a képeken mutattuk, hanem legalább 100 nagyobb adatbázis információit kell összekötnünk, a feladat tehát óriási, hiszen a rendszert úgy kell fenntartani, hogy a naponta sokezresével érkező új adatokat csoportosítsuk, hiperlinkekkel egymáshoz kapcsoljuk, hogy a felhasználók azonnal kérdezni tudják a rendszert. Adatainkat tehát nemcsak tárolni kell, hanem intelligensen lekérdezhető formába kell hozni.