A játékos júniusban távozott a Real Madridtól, de nem sikerült új csapatot találnia.
A 34 éves hálóőr 1996-ban az 1. FC Kölntől került a spanyol együtteshez, amellyel 1998-ban és 2000-ben is megnyerte a Bajnokok Ligáját. Illgner utoljára 2000 februárjában védett tétmérkőzésen, előbb Cesar Sanchez, majd Iker Casillas szorította ki a kezdőcsapatból.